[SSL]マルチドメイン証明書を利用しますが、ロードバランサーでCSRを作成することができますか

作成することはできません。
CSR作成時に「サブジェクト代替名(SAN属性)」を入力することはできません。

Opensslなどを利用して、SAN付きのCSRを作成いただきますようお願い致します。
ロードバランサー以外でCSRを行い作成された、秘密鍵や証明書をインポートすることは可能です。

<対象製品>
SX-3950
SX-3945
SX-3940
SX-3920
SX-3990 (VirtualEdition)
SX-3850
SX-3845
SX-3840
SX-3820